175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09351 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0741  exodeoxyribonuclease V  74.79 
 
 		 481 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.384305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1924  exodeoxyribonuclease V  73.54 
 
 		 483 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09351  exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 491 aa  988    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0679  hypothetical protein  58.33 
 
 		 486 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  57.96 
 
 		 486 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15131  exodeoxyribonuclease V  59.55 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  29.91 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  28.66 
 
 		 678 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  32.65 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  32.99 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  32.57 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  33.33 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  31.66 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  29.22 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  32.14 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  25.88 
 
 		 924 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  25.88 
 
 		 924 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  25.45 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  30.5 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  26.29 
 
 		 754 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  31.96 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  32.11 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  31 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  31.86 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  30.5 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  24.85 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  23.49 
 
 		 813 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  29.67 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  30.41 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  22.85 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  29.65 
 
 		 727 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  25.99 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  31.49 
 
 		 744 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.46 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  26.36 
 
 		 369 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  25.99 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  31.53 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  30.34 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  32.37 
 
 		 1214 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  30.6 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  29.35 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  28.04 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  29.03 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  30.39 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  25.5 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  25.35 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  28.85 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  31 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 372 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  31.53 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  30.92 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  29.12 
 
 		 733 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  28.04 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 761 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  29.61 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  28.85 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  28.85 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  28.02 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  32.5 
 
 		 739 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  31.82 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  27.67 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  30.82 
 
 		 740 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  27.67 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  27.96 
 
 		 727 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  33.01 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  30.51 
 
 		 733 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  29.94 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  30.51 
 
 		 733 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  26.14 
 
 		 740 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  27.23 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  27.93 
 
 		 731 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  27.87 
 
 		 1665 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  33.58 
 
 		 737 aa  53.5  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  28.65 
 
 		 738 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  27.33 
 
 		 726 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  31.75 
 
 		 726 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3101  ATPase  25.75 
 
 		 517 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01029  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.51 
 
 		 731 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.539328  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.02 
 
 		 825 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  27.05 
 
 		 749 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  26.01 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  28.57 
 
 		 724 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  28.83 
 
 		 659 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5137  Exodeoxyribonuclease V  32.65 
 
 		 749 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  29.38 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  31.37 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0847  ATPase  27.97 
 
 		 515 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.25 
 
 		 598 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  30.3 
 
 		 736 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  34.09 
 
 		 740 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  28.29 
 
 		 768 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  33.62 
 
 		 742 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.56 
 
 		 698 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  32.52 
 
 		 369 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  28.12 
 
 		 744 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  28.12 
 
 		 744 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  29.56 
 
 		 698 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  31.25 
 
 		 776 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  30.52 
 
 		 719 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  38.32 
 
 		 732 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>