More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09631 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  100 
 
 
576 aa  1165    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  45.33 
 
 
574 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  41.8 
 
 
573 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  49.03 
 
 
530 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  41.09 
 
 
573 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  49.47 
 
 
526 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.29 
 
 
563 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12081  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.06 
 
 
567 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0649311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1113  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.73 
 
 
566 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.327644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.69 
 
 
567 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.57 
 
 
650 aa  181  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.57 
 
 
646 aa  181  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.26 
 
 
609 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  31.98 
 
 
611 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  31.98 
 
 
611 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  31.98 
 
 
611 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  31.98 
 
 
611 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  31.98 
 
 
611 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1170  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.89 
 
 
655 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.11 
 
 
739 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000685942 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.6 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  31.6 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  31.6 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  31.6 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  31.41 
 
 
608 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  31.41 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  31.98 
 
 
618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  31.41 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2966  exonuclease V subunit alpha  31.6 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  31.6 
 
 
608 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  31.21 
 
 
721 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1902  exodeoxyribonuclease V  29.62 
 
 
631 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4670  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.27 
 
 
691 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0281806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  31.91 
 
 
619 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5137  Exodeoxyribonuclease V  33.06 
 
 
749 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34484  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.92 
 
 
683 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1892  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.18 
 
 
594 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087164  hitchhiker  0.00000000000433292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  30.51 
 
 
652 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4672  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.79 
 
 
691 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4850  exodeoxyribonuclease V alpha chain  31.05 
 
 
720 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.61173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.77 
 
 
588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1044  exonuclease V subunit alpha  30.24 
 
 
657 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0992  exonuclease V subunit alpha  30.6 
 
 
657 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  30.31 
 
 
735 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.76 
 
 
601 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.81 
 
 
576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4536  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.6 
 
 
691 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636293  normal  0.640936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  32.36 
 
 
607 aa  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0762  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.09 
 
 
691 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.089759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.73 
 
 
697 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1460  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.75 
 
 
698 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002686  exodeoxyribonuclease V alpha chain  29.7 
 
 
715 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3813  exonuclease V subunit alpha  32.56 
 
 
621 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.752384  hitchhiker  0.00686322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  26.91 
 
 
734 aa  150  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  31.01 
 
 
744 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1758  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.81 
 
 
737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  32.86 
 
 
706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0690  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.67 
 
 
702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.62 
 
 
598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.36 
 
 
551 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.16 
 
 
579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0903  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.22 
 
 
580 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03300  hypothetical protein  29.09 
 
 
725 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0897  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.9 
 
 
580 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.87 
 
 
787 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0914  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.9 
 
 
580 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  31.01 
 
 
750 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0682  exodeoxyribonuclease V alpha chain  29.1 
 
 
674 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2112  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.45 
 
 
686 aa  143  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.74 
 
 
731 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3374  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.03 
 
 
616 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  31.31 
 
 
733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  31.42 
 
 
728 aa  141  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.87 
 
 
641 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  28.15 
 
 
738 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  28.57 
 
 
728 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2643  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.57 
 
 
682 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  31.31 
 
 
733 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  30.57 
 
 
688 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  32.21 
 
 
727 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  28.8 
 
 
727 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.68 
 
 
639 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1935  exodeoxyribonuclease V  31.71 
 
 
683 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280429  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1623  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.31 
 
 
679 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127673  normal  0.170261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.69 
 
 
687 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.17 
 
 
604 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  29.07 
 
 
736 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.05 
 
 
601 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  29.12 
 
 
733 aa  136  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  30.29 
 
 
731 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  29.28 
 
 
659 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.95 
 
 
584 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2147  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.18 
 
 
712 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.44 
 
 
588 aa  135  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  29.61 
 
 
768 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01029  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.16 
 
 
731 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.539328  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  30.31 
 
 
731 aa  134  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.37 
 
 
581 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1851  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.19 
 
 
710 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  28 
 
 
740 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>