93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0941 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 445 aa  905    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  47.18 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  48.97 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  47.63 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  45.41 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  42.92 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  42.92 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  40.27 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  33.75 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  28.01 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  31.57 
 
 		 764 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  30.29 
 
 		 829 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  28.13 
 
 		 738 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  28.37 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  28.38 
 
 		 669 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  32.02 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  28.23 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  26.67 
 
 		 759 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  28.57 
 
 		 646 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  28.12 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  26.32 
 
 		 734 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  29.46 
 
 		 659 aa  147  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  24.32 
 
 		 761 aa  146  9e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  27.87 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  27.87 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  27.64 
 
 		 782 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  28.24 
 
 		 639 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  25.39 
 
 		 782 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  27.7 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  26.48 
 
 		 779 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  27.04 
 
 		 614 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  27.8 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.9 
 
 		 691 aa  133  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  24.01 
 
 		 628 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  23.52 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  23.54 
 
 		 661 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  48.31 
 
 		 100 aa  93.6  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.72 
 
 		 739 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  24.4 
 
 		 738 aa  63.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  37.62 
 
 		 130 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  22.91 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  22.58 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  25.43 
 
 		 678 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  22.22 
 
 		 740 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  20.95 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  22.22 
 
 		 742 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  21.43 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  22.7 
 
 		 744 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  22.35 
 
 		 738 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  20.48 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  22.14 
 
 		 698 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  21.99 
 
 		 698 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  47.17 
 
 		 1579 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  22.07 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  20.83 
 
 		 735 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  20.48 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.2 
 
 		 732 aa  48.9  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  20.97 
 
 		 727 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  27.03 
 
 		 736 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  23.72 
 
 		 727 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  23.16 
 
 		 733 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  24.15 
 
 		 728 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  19.82 
 
 		 772 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  24.2 
 
 		 480 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  21.05 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  23.53 
 
 		 728 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  20.99 
 
 		 742 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  29.63 
 
 		 1214 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  24.66 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  21.29 
 
 		 710 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  27.21 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1259 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  22.14 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  21.39 
 
 		 738 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  22.45 
 
 		 733 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  23.66 
 
 		 736 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  23.93 
 
 		 902 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  24.83 
 
 		 725 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  23.53 
 
 		 792 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  20.89 
 
 		 733 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  22.91 
 
 		 728 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  21.91 
 
 		 806 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  22.7 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  34.09 
 
 		 814 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  22.01 
 
 		 1168 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  21.84 
 
 		 739 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  23.02 
 
 		 735 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  22.4 
 
 		 731 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  23.9 
 
 		 737 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  26.19 
 
 		 659 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  22.6 
 
 		 740 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>