146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0207 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  100 
 
 
764 aa  1570    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  41.08 
 
 
759 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  41.38 
 
 
747 aa  565  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  39.15 
 
 
734 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  38.53 
 
 
761 aa  501  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  39.84 
 
 
738 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  42.09 
 
 
639 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  43.07 
 
 
829 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  40.09 
 
 
680 aa  337  7e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  41.46 
 
 
517 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  39.49 
 
 
445 aa  296  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  38.43 
 
 
431 aa  276  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  37.27 
 
 
438 aa  276  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  36.51 
 
 
782 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  36.51 
 
 
782 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  36.51 
 
 
782 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  34.95 
 
 
779 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  34.56 
 
 
782 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  34.21 
 
 
493 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  30.32 
 
 
614 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  31.92 
 
 
442 aa  184  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  29.87 
 
 
669 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  31.02 
 
 
485 aa  172  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  31.4 
 
 
659 aa  167  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  31.57 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  31.28 
 
 
435 aa  162  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  31.31 
 
 
438 aa  160  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  29.64 
 
 
646 aa  156  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  30.15 
 
 
653 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  28.73 
 
 
472 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  27.68 
 
 
691 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  28.35 
 
 
447 aa  154  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  28.35 
 
 
447 aa  154  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  30.31 
 
 
439 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  29.64 
 
 
420 aa  144  8e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  29.64 
 
 
422 aa  138  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  27.05 
 
 
661 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  26.91 
 
 
628 aa  117  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  40.34 
 
 
130 aa  101  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  23.06 
 
 
659 aa  67.4  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  24.21 
 
 
872 aa  65.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  23.33 
 
 
738 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  23.04 
 
 
866 aa  64.7  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  28.05 
 
 
367 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  28.5 
 
 
678 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  25.65 
 
 
375 aa  61.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  22.2 
 
 
914 aa  61.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  26.94 
 
 
368 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  24.64 
 
 
375 aa  60.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  25.61 
 
 
375 aa  60.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 
742 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  26.52 
 
 
375 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  29.53 
 
 
469 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.36 
 
 
739 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.4 
 
 
741 aa  59.3  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  26.04 
 
 
726 aa  58.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  21.83 
 
 
747 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  23.47 
 
 
725 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  23.4 
 
 
742 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  25.67 
 
 
373 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  25.81 
 
 
372 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  24.17 
 
 
738 aa  57.4  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  25.67 
 
 
373 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  24.74 
 
 
688 aa  56.6  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  24.88 
 
 
373 aa  55.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  22.75 
 
 
653 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  26.8 
 
 
372 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  23.3 
 
 
746 aa  55.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.26 
 
 
709 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.51 
 
 
718 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  34.81 
 
 
365 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  24.16 
 
 
369 aa  55.1  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  30.05 
 
 
369 aa  55.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  21.88 
 
 
740 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  24.32 
 
 
373 aa  55.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  24.32 
 
 
720 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  21.91 
 
 
698 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  22.15 
 
 
739 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.36 
 
 
732 aa  54.7  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  34.81 
 
 
365 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.71 
 
 
722 aa  54.3  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  34.81 
 
 
365 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  34.81 
 
 
365 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1113  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.94 
 
 
566 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.327644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  24.65 
 
 
475 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  23.33 
 
 
768 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  21.35 
 
 
744 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  21.68 
 
 
698 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  28.77 
 
 
376 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  23.24 
 
 
736 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.29 
 
 
709 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.29 
 
 
709 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  21.85 
 
 
1100 aa  52  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  22.46 
 
 
792 aa  52  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  23.65 
 
 
728 aa  51.6  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  31.88 
 
 
918 aa  51.6  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  32.7 
 
 
363 aa  51.6  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  24 
 
 
736 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  24.35 
 
 
567 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  22.84 
 
 
735 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>