169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1779 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1779  ATPase  100 
 
 		 422 aa  862    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  39.4 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  41.07 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  38.57 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  39.52 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  39.52 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  34.93 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  33.75 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  35.68 
 
 		 420 aa  202  9e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  32.23 
 
 		 734 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  30.77 
 
 		 829 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  31.83 
 
 		 738 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  30.41 
 
 		 747 aa  159  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  29.02 
 
 		 485 aa  159  9e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  30.58 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  32.01 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  31.19 
 
 		 761 aa  153  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  28.92 
 
 		 639 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  30.1 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  29.27 
 
 		 759 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  31.76 
 
 		 680 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.36 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  27.59 
 
 		 669 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  29.64 
 
 		 764 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  28.61 
 
 		 779 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  27.27 
 
 		 782 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  28.03 
 
 		 782 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  28.03 
 
 		 782 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  27.79 
 
 		 782 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  28.61 
 
 		 614 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.77 
 
 		 691 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  28.76 
 
 		 659 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  25.37 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  28.5 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  24.11 
 
 		 628 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  26.32 
 
 		 661 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  28.3 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  27.94 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  24.75 
 
 		 742 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 		 1579 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.47 
 
 		 732 aa  67  0.0000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.79 
 
 		 728 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  25.52 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  24.94 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  25.35 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  30.81 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.42 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  22.53 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  23.95 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  26.8 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  23.64 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  24.53 
 
 		 711 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  28.92 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  26.47 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  30.52 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  24.73 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  44.16 
 
 		 100 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  27.84 
 
 		 881 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  23.19 
 
 		 731 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  24.71 
 
 		 776 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  24.06 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  27.75 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  23.31 
 
 		 733 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  22.33 
 
 		 733 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  25.12 
 
 		 741 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  23.31 
 
 		 733 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  22.95 
 
 		 710 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  22.28 
 
 		 750 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  30.63 
 
 		 742 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.25 
 
 		 744 aa  54.3  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  24.1 
 
 		 725 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  29.15 
 
 		 768 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  33.93 
 
 		 731 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.8 
 
 		 563 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  25.98 
 
 		 746 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  23.56 
 
 		 735 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.21 
 
 		 576 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  23.45 
 
 		 907 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  30.69 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  27.09 
 
 		 686 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  28.98 
 
 		 659 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  30.69 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  23.84 
 
 		 744 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  24.35 
 
 		 637 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  29.28 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.03 
 
 		 747 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  29.1 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  24 
 
 		 738 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  30.58 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  30.39 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  23.04 
 
 		 825 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.24 
 
 		 741 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  29.41 
 
 		 475 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  22.13 
 
 		 730 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.54 
 
 		 474 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  23.37 
 
 		 754 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  28.95 
 
 		 678 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  21.84 
 
 		 736 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>