80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0522 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  100 
 
 		 420 aa  843    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  53 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  53 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  49.39 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  46.88 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  46.52 
 
 		 438 aa  358  9e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  45.41 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  43.27 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  35.68 
 
 		 422 aa  202  9e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  32.1 
 
 		 680 aa  170  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  30.22 
 
 		 782 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  30.22 
 
 		 782 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  29.98 
 
 		 782 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  34.14 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  33.24 
 
 		 829 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  29.74 
 
 		 779 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  29.93 
 
 		 738 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  28.2 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  29.26 
 
 		 782 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  30.7 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  27.2 
 
 		 761 aa  153  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  30.27 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.95 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  29.82 
 
 		 759 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  29.64 
 
 		 764 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  29.61 
 
 		 614 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  27.58 
 
 		 747 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  27.48 
 
 		 734 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  26.08 
 
 		 493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  28.61 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  91.3 
 
 		 100 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  28.34 
 
 		 659 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  27.95 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  27.08 
 
 		 669 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.99 
 
 		 691 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  26.1 
 
 		 646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  25.68 
 
 		 653 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  25.62 
 
 		 661 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  25.38 
 
 		 628 aa  90.1  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  21.29 
 
 		 918 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  33.61 
 
 		 130 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  25.56 
 
 		 574 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.05 
 
 		 742 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  22.87 
 
 		 907 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  23.84 
 
 		 833 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  21.74 
 
 		 576 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  22.54 
 
 		 710 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.57 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  22.96 
 
 		 834 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  22.62 
 
 		 736 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  23.64 
 
 		 738 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  21.29 
 
 		 974 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  23.62 
 
 		 792 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  22.7 
 
 		 735 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  19.39 
 
 		 944 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  23.85 
 
 		 881 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  21.82 
 
 		 727 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  23.82 
 
 		 879 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  24.6 
 
 		 806 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1259 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  23.84 
 
 		 737 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  22.37 
 
 		 742 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  23.15 
 
 		 730 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  21.96 
 
 		 688 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  20.44 
 
 		 637 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  21.23 
 
 		 739 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  19.76 
 
 		 1025 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  23.44 
 
 		 726 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  24.16 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  22.77 
 
 		 738 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  26.98 
 
 		 740 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  21.52 
 
 		 736 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  39.62 
 
 		 1579 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  23.44 
 
 		 731 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  23.08 
 
 		 744 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  44.07 
 
 		 567 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  37.31 
 
 		 901 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  23.39 
 
 		 740 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  22.67 
 
 		 726 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  29.33 
 
 		 486 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>