More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1191 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1191  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  100 
 
 		 577 aa  1188    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  28.99 
 
 		 728 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  29.65 
 
 		 726 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.99 
 
 		 733 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  29.91 
 
 		 738 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  27.46 
 
 		 686 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  30.39 
 
 		 728 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  29.29 
 
 		 739 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  29.74 
 
 		 728 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.32 
 
 		 737 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  31.03 
 
 		 731 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  28.45 
 
 		 727 aa  134  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  26.86 
 
 		 731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  28.2 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  30.41 
 
 		 731 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  27.74 
 
 		 738 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  28.45 
 
 		 728 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  27.27 
 
 		 728 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  25.16 
 
 		 761 aa  128  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  27.64 
 
 		 740 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  29.45 
 
 		 727 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  29.07 
 
 		 733 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  27.12 
 
 		 726 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  29.52 
 
 		 719 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  28.72 
 
 		 733 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  27.45 
 
 		 728 aa  125  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  29.05 
 
 		 735 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  29.19 
 
 		 736 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  27.29 
 
 		 750 aa  124  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  28.07 
 
 		 741 aa  124  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  27.6 
 
 		 744 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.79 
 
 		 742 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  28.76 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  30.33 
 
 		 754 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  28.57 
 
 		 724 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  30.03 
 
 		 788 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  29.13 
 
 		 742 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  29.03 
 
 		 653 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  29.39 
 
 		 736 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  28.72 
 
 		 725 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  29.12 
 
 		 750 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  30.88 
 
 		 747 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  31.41 
 
 		 659 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  27.59 
 
 		 744 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  29.51 
 
 		 715 aa  114  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  28.25 
 
 		 768 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  25.56 
 
 		 710 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  27.3 
 
 		 719 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  27.5 
 
 		 738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  28.77 
 
 		 747 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  27.77 
 
 		 746 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  28.42 
 
 		 740 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  29.02 
 
 		 749 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  27.09 
 
 		 722 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  29.05 
 
 		 731 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  31.73 
 
 		 776 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  27.24 
 
 		 749 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  28.6 
 
 		 739 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.83 
 
 		 746 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  26.78 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  27.86 
 
 		 735 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.92 
 
 		 698 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  26.35 
 
 		 740 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  27.61 
 
 		 698 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  29.28 
 
 		 778 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  29.28 
 
 		 778 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  22.17 
 
 		 743 aa  100  9e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  27.84 
 
 		 736 aa  100  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  29.28 
 
 		 778 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  29.28 
 
 		 778 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.28 
 
 		 778 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.28 
 
 		 778 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  29.28 
 
 		 778 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  29.28 
 
 		 778 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  29.28 
 
 		 770 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  29.15 
 
 		 778 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  24.43 
 
 		 745 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  27.81 
 
 		 772 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  26.79 
 
 		 732 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  26.21 
 
 		 728 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  31.55 
 
 		 816 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  26.08 
 
 		 730 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  29.48 
 
 		 742 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  27.27 
 
 		 731 aa  97.4  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  28.96 
 
 		 762 aa  97.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  29.15 
 
 		 772 aa  97.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  30.9 
 
 		 732 aa  96.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  25.36 
 
 		 688 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  27 
 
 		 744 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  25.72 
 
 		 740 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  27 
 
 		 744 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  26.61 
 
 		 711 aa  95.1  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  28.78 
 
 		 784 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.23 
 
 		 825 aa  94.7  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  27.3 
 
 		 825 aa  94  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  27.3 
 
 		 825 aa  94  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.28 
 
 		 721 aa  93.6  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10640  exonuclease V alpha subunit recD  30.17 
 
 		 575 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.47997e-19  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  24.26 
 
 		 741 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  25 
 
 		 717 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>