More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0518 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 465 aa  967    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  70.86 
 
 		 457 aa  700    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  67.56 
 
 		 470 aa  641    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  75.22 
 
 		 459 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  70.73 
 
 		 452 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  55.22 
 
 		 609 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  54.3 
 
 		 609 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  55.43 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  55.4 
 
 		 620 aa  518  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  54.44 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  52.1 
 
 		 608 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  53.16 
 
 		 311 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  42.68 
 
 		 419 aa  299  6e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  38.72 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  32.53 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  33.18 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  35.95 
 
 		 353 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  30.52 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  31.43 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  31.5 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  29.74 
 
 		 492 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  29.86 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  28.76 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  30.35 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  29.33 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  29.35 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  30.34 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  29.03 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  27.97 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  27.68 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  27.97 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  27.89 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  27.79 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  30.55 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  26.77 
 
 		 514 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.89 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  28 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  29.83 
 
 		 383 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  27.53 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  27.61 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  26.33 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  29.97 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  28.32 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  28.22 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  28.9 
 
 		 389 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  29.06 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  28.45 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  27.37 
 
 		 504 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  30.88 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  28.28 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  28.37 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  29.02 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  28.15 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  27.84 
 
 		 386 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  29.15 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  30.37 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  26.79 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  27.68 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  27.41 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  29.71 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  27.68 
 
 		 386 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  27.09 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  27.64 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  28.28 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  27.45 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  26.51 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  28.94 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  26.74 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  27.56 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  27.59 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  27.58 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  28.65 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  27.93 
 
 		 509 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  27.19 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  26.9 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  28.15 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.74 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  29.23 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  26.98 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  27 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  27.99 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  27.41 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  26.42 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  27.51 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  28.44 
 
 		 536 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3171  2-isopropylmalate synthase  27.53 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  25.9 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  28.85 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  24.67 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  28.15 
 
 		 516 aa  103  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  28.33 
 
 		 503 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  27.73 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  28.89 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  27.35 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  26.05 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  29.85 
 
 		 511 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  26.38 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  25.96 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  28.82 
 
 		 515 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  26.95 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>