More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1075 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  68.25 
 
 
442 aa  640    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 
425 aa  874    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  66.47 
 
 
353 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  34.9 
 
 
452 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  32.7 
 
 
459 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  33.58 
 
 
620 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  32.46 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  32.94 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  32 
 
 
609 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  32.93 
 
 
609 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  37.36 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  32.27 
 
 
611 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  33.18 
 
 
465 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  35 
 
 
377 aa  208  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  37.93 
 
 
382 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  36 
 
 
505 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  32.6 
 
 
608 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  34.16 
 
 
390 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  34.31 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  37.43 
 
 
381 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  35.45 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  33.95 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  31.59 
 
 
604 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  37.54 
 
 
381 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  31.57 
 
 
485 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  34.6 
 
 
383 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  33.06 
 
 
492 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  35.59 
 
 
386 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  33.24 
 
 
492 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  36.87 
 
 
385 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  33.33 
 
 
419 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  34.01 
 
 
406 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  37.08 
 
 
389 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  34.04 
 
 
389 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  33.63 
 
 
492 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  32.9 
 
 
378 aa  193  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  33.43 
 
 
492 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  37.09 
 
 
377 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  36.53 
 
 
372 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 
514 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  32.49 
 
 
380 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  37.05 
 
 
377 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  36.5 
 
 
382 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  33.62 
 
 
514 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  35.96 
 
 
383 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  31.28 
 
 
492 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  35.51 
 
 
387 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  31.83 
 
 
504 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  34.02 
 
 
377 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.76 
 
 
514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  32.99 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  35.52 
 
 
383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  34.38 
 
 
514 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  32.63 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  35.76 
 
 
377 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  35.76 
 
 
377 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  35.69 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  32.92 
 
 
400 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  33.72 
 
 
378 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  34.83 
 
 
382 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  35.03 
 
 
376 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  35.29 
 
 
388 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.58 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  34.13 
 
 
508 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  32.46 
 
 
405 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  32.75 
 
 
503 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  32.79 
 
 
514 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  32.48 
 
 
386 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.82 
 
 
347 aa  176  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  35.8 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  32.74 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  33.07 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  31.29 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  32.29 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  32.56 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  36.9 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.64 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  32.57 
 
 
386 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  32.49 
 
 
503 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  32 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  32.49 
 
 
436 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.57 
 
 
496 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  30.67 
 
 
502 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  34.62 
 
 
380 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  32.64 
 
 
509 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  35.05 
 
 
388 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  33.23 
 
 
390 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  31.05 
 
 
389 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  32.73 
 
 
515 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  32.38 
 
 
460 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  30.26 
 
 
438 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  34.12 
 
 
393 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  31.39 
 
 
515 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  29.53 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  33.24 
 
 
387 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  31.49 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  33.01 
 
 
524 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0833  pyruvate carboxyltransferase  31.72 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  34.58 
 
 
556 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  36.96 
 
 
311 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>