More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2246 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 436 aa  877    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  39.08 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  37.99 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  38.58 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  39.27 
 
 		 609 aa  295  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  38.72 
 
 		 465 aa  292  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  37.07 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  38.41 
 
 		 620 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  37.79 
 
 		 609 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  38.39 
 
 		 608 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  36.55 
 
 		 604 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  39.03 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  38.49 
 
 		 311 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  32.83 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  32.83 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  31.36 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  35.24 
 
 		 353 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  29.83 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  28.99 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  29.55 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  30.35 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  28.41 
 
 		 492 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  27.7 
 
 		 492 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  27.03 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  27.75 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  32.3 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  28.43 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  33.52 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  29.97 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  30.23 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  30.59 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  29.97 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  33.33 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  30 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  31.47 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  29.35 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  27.11 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  26.32 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  28.12 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  31.73 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.75 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  26.2 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  31.73 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  30.75 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  28.65 
 
 		 380 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  27.46 
 
 		 492 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  28.01 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  28.73 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  29.53 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  28.02 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  25.89 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  28.27 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  32.88 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  27.67 
 
 		 377 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  29.22 
 
 		 383 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  28.28 
 
 		 492 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  31.11 
 
 		 460 aa  99.8  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  33.58 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  28.29 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  30.67 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  30.14 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.08 
 
 		 504 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  30.58 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  31.25 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  31.37 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  26.7 
 
 		 514 aa  96.7  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  26.67 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  27.02 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  26.98 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  28.05 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  33.69 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  30.34 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  27.02 
 
 		 514 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  29.33 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  28.47 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  28.53 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1477  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  30.03 
 
 		 538 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.583378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  26.92 
 
 		 502 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  27.7 
 
 		 514 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  30.4 
 
 		 394 aa  93.2  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3672  pyruvate carboxyltransferase  27.03 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  28.24 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  27.41 
 
 		 347 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  26.5 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  30.88 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  33.92 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  28.14 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4715  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  28.57 
 
 		 537 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1105  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  30.56 
 
 		 561 aa  90.1  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  28.73 
 
 		 345 aa  90.1  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  26.86 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  29.41 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  28.32 
 
 		 415 aa  90.1  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  29.75 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  25.61 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  32.39 
 
 		 379 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  30.92 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0718  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  28.35 
 
 		 538 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0969  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  31.03 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  30.86 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>