More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2092 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  65.95 
 
 		 604 aa  857    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 620 aa  1301    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  62.19 
 
 		 611 aa  805    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  65.55 
 
 		 609 aa  852    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  56.19 
 
 		 609 aa  696    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  66 
 
 		 608 aa  853    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  55.4 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  54.71 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  52.64 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  55.09 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  51.49 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  56.76 
 
 		 311 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  39.23 
 
 		 419 aa  289  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  38.57 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  32.06 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  33.58 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  34.33 
 
 		 353 aa  194  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  29.31 
 
 		 383 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  28.19 
 
 		 382 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  29.01 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  27.91 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  28.46 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  27.78 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  28.81 
 
 		 381 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  27.37 
 
 		 492 aa  122  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  29.01 
 
 		 400 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  28.49 
 
 		 381 aa  121  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.24 
 
 		 385 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  28.86 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  27.23 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  29.12 
 
 		 383 aa  113  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  25.91 
 
 		 392 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  29.89 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  26.82 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  28.49 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  26.38 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  29.63 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  28.72 
 
 		 402 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  27.78 
 
 		 390 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  27.78 
 
 		 377 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  26.97 
 
 		 503 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  27.86 
 
 		 378 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  28.01 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  27.7 
 
 		 378 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  27.37 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  27.58 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  28.61 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  26.5 
 
 		 386 aa  107  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  29 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  27.65 
 
 		 382 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  29 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  27.59 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  26.96 
 
 		 394 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  28.21 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  26 
 
 		 377 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  25 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  28.07 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  26.58 
 
 		 504 aa  103  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  27.07 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  27.33 
 
 		 377 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  27.19 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  27.49 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  27.17 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  26.96 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  27.12 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  27.57 
 
 		 383 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  27.61 
 
 		 372 aa  101  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  27.32 
 
 		 500 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  26.04 
 
 		 389 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0529  homocitrate synthase  25.88 
 
 		 358 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  26.18 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  26.18 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  26.22 
 
 		 400 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  27.17 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  25.9 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0833  pyruvate carboxyltransferase  26.43 
 
 		 373 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  26.47 
 
 		 377 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  24.4 
 
 		 516 aa  98.6  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  26.96 
 
 		 381 aa  98.2  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  27.47 
 
 		 372 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  26.9 
 
 		 378 aa  97.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  26.89 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  26.1 
 
 		 378 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  27.74 
 
 		 460 aa  97.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  26.59 
 
 		 406 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3672  pyruvate carboxyltransferase  27.08 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  27.15 
 
 		 387 aa  95.1  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  26.01 
 
 		 387 aa  94.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1614  homocitrate synthase  27.88 
 
 		 415 aa  94.4  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.989328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  27.11 
 
 		 395 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  26.96 
 
 		 380 aa  94  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  25.27 
 
 		 503 aa  94  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  27.68 
 
 		 448 aa  93.2  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  26.53 
 
 		 384 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  26.75 
 
 		 386 aa  93.6  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  24.42 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  26.1 
 
 		 377 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  27.15 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  25.66 
 
 		 390 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  26.5 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>