More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2177 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  65.25 
 
 		 470 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  70.86 
 
 		 465 aa  700    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 457 aa  954    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  80.18 
 
 		 459 aa  797    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  62.67 
 
 		 452 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  54.36 
 
 		 609 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  51.74 
 
 		 609 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  54.42 
 
 		 604 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  54.71 
 
 		 620 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  52.8 
 
 		 608 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  50.77 
 
 		 611 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  50.67 
 
 		 311 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  37.07 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  39.02 
 
 		 419 aa  279  6e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  35.28 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  32.94 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  33.03 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  30.14 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  30.14 
 
 		 381 aa  137  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  28.75 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  28.9 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  29.19 
 
 		 380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  26.98 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.86 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.17 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  27.86 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  29.52 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  27.73 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  27.68 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  27.71 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  27.52 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  27.71 
 
 		 514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  26.99 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  27.88 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  27.88 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  26.11 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  28.13 
 
 		 514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  27.83 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  27.91 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  25.46 
 
 		 377 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  25.46 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  27.22 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  26.93 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  27.83 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  26.77 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  27.48 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  26.87 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  28.27 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  26.73 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  27.91 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  26.88 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  28.65 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  25.94 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  28.23 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  27.35 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  25.91 
 
 		 378 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  29.28 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  26.76 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  26.99 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  28.98 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  26.99 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  27.85 
 
 		 511 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  28.23 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  26.85 
 
 		 381 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  28.03 
 
 		 380 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  26.05 
 
 		 383 aa  107  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  28.27 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  26.03 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  27.27 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  29.24 
 
 		 516 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  28.15 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  27.57 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  27.76 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  28.45 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  28.45 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  28.15 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  25.94 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  28.15 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  28.15 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  28.15 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  27.96 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  27.09 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  27.73 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  27.52 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  28.06 
 
 		 555 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  25.44 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  25.23 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  29.88 
 
 		 513 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  26.96 
 
 		 502 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  25.23 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  27.71 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  29.38 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  27.69 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  28.1 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  25.42 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  26.82 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  28.35 
 
 		 515 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  26.71 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  29.08 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  29.59 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>