More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1549 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 609 aa  1267    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  76.21 
 
 		 604 aa  999    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  65.44 
 
 		 620 aa  853    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  55.8 
 
 		 609 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  68.42 
 
 		 611 aa  901    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  86.37 
 
 		 608 aa  1120    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  54.3 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  53.71 
 
 		 459 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  54.36 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  54.21 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  54.29 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  56.42 
 
 		 311 aa  362  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  39.49 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  37.79 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  32.85 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  32.43 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  33.52 
 
 		 353 aa  193  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  31.55 
 
 		 381 aa  137  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  28.82 
 
 		 382 aa  133  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  29.43 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  26.85 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  28.45 
 
 		 383 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  30.33 
 
 		 503 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  26.38 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  30.2 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  28.86 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  29.23 
 
 		 380 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  26.38 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  26.83 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.6 
 
 		 385 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  31.29 
 
 		 390 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.46 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  29.1 
 
 		 397 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  29.94 
 
 		 384 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  30.29 
 
 		 386 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  30.29 
 
 		 386 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  29.02 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  30.14 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  30.5 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  30.12 
 
 		 383 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  27.25 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  28.3 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  29.01 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  28.97 
 
 		 382 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  29.03 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  28.33 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  28.1 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  27.12 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  28.25 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  29.79 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  28.54 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  28.41 
 
 		 383 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  30.06 
 
 		 378 aa  107  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  28.41 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  26.52 
 
 		 386 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  28.37 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  28.12 
 
 		 372 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  27.02 
 
 		 386 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  27.75 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  30.68 
 
 		 384 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  27.64 
 
 		 377 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  26.77 
 
 		 386 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  27.54 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  29.01 
 
 		 379 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  27.32 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  29.44 
 
 		 402 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  27.78 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  29.69 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  28.24 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  26.67 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  26.52 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  27.24 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.57 
 
 		 504 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  29.41 
 
 		 388 aa  101  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  26.85 
 
 		 514 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  24.38 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  28.7 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  27.76 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  26.88 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  27.45 
 
 		 400 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  28.57 
 
 		 378 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  24.93 
 
 		 492 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2865  pyruvate carboxyltransferase  28.73 
 
 		 393 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.134152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  26.8 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  27.07 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  26.63 
 
 		 386 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  26.8 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4715  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  24.65 
 
 		 537 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  25.97 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  26.8 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  25.32 
 
 		 508 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  26.77 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  28.37 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  27.83 
 
 		 389 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  27.27 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  25.89 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  26.24 
 
 		 525 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  26.65 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  26.89 
 
 		 377 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  29.97 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>