More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0336 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 353 aa  725    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  65.98 
 
 		 442 aa  481  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  66.47 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  34.33 
 
 		 620 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  34.09 
 
 		 609 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  33.52 
 
 		 611 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  33.63 
 
 		 452 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  35.95 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  31.53 
 
 		 608 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  32.85 
 
 		 604 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  36.06 
 
 		 419 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  34.33 
 
 		 609 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.86 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  35.22 
 
 		 460 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  36.24 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  35.44 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  32.73 
 
 		 470 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  33.13 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  35.14 
 
 		 516 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  33.54 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  31.98 
 
 		 485 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  32.73 
 
 		 459 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  36.64 
 
 		 509 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  33.94 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  33.03 
 
 		 457 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  35.48 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  34.15 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  34.45 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  32.06 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  35.13 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  36.46 
 
 		 492 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  32.34 
 
 		 390 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  37.32 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  35.03 
 
 		 515 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  32.62 
 
 		 492 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  34.33 
 
 		 508 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  32.58 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  34.89 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  34.58 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  36.79 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  37.73 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  37.55 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.11 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  34.63 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  33.64 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  33.23 
 
 		 492 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  35.24 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  33.64 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  38.27 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.38 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  36.43 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  32.24 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  33.43 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  36.2 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  36.96 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  36.26 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  32.26 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  32.93 
 
 		 377 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  35.36 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  31.4 
 
 		 483 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  32.42 
 
 		 442 aa  152  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  33.21 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  32.52 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  31.42 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  35.23 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  34.43 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  34.74 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  34.77 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  34.2 
 
 		 511 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  31.02 
 
 		 514 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  34.17 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  33.57 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  33.44 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  34.74 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  31.8 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  36.63 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  33.89 
 
 		 378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  36.84 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  34.41 
 
 		 510 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  36.53 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  34.08 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.16 
 
 		 500 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  35.53 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  33.14 
 
 		 512 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  30.88 
 
 		 446 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.16 
 
 		 514 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  31.1 
 
 		 514 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  32.99 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  33.58 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  34.94 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  31.71 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  34.15 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  32.94 
 
 		 516 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  34.8 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  30.33 
 
 		 514 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  32.46 
 
 		 518 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  32.74 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  29.88 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  33.63 
 
 		 519 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  33.82 
 
 		 524 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>