More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0520 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  65.95 
 
 		 620 aa  857    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  100 
 
 		 604 aa  1259    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  65.44 
 
 		 611 aa  856    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  55.24 
 
 		 609 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  76.04 
 
 		 608 aa  990    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  76.17 
 
 		 609 aa  998    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  54.44 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  54.42 
 
 		 457 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  51.48 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  51.64 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  51.04 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  56.57 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  39.8 
 
 		 419 aa  299  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  36.55 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  30.55 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  31.59 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  32.85 
 
 		 353 aa  180  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  31.09 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  29.76 
 
 		 382 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  27.1 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  26.83 
 
 		 492 aa  122  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  27.37 
 
 		 492 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  28.78 
 
 		 492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  29.65 
 
 		 377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  28.85 
 
 		 381 aa  114  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  29.48 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  27.08 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  29.97 
 
 		 394 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  28.78 
 
 		 390 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  28.78 
 
 		 397 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  28.12 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  27.58 
 
 		 383 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  28.85 
 
 		 389 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  30.37 
 
 		 386 aa  110  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  30.37 
 
 		 386 aa  110  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  28.86 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  29.48 
 
 		 387 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  28.25 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  27.48 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  28.61 
 
 		 384 aa  107  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  30.52 
 
 		 383 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.03 
 
 		 385 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  26.8 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.86 
 
 		 386 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  29.18 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  29.11 
 
 		 383 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  27.09 
 
 		 524 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  29.28 
 
 		 383 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0718  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.99 
 
 		 538 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  27.38 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  26.55 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  24.74 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  28.49 
 
 		 386 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  27.67 
 
 		 386 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  26.17 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  27.03 
 
 		 386 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  24.35 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  28.32 
 
 		 382 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  25.9 
 
 		 532 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  26.19 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  26.99 
 
 		 386 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  27.87 
 
 		 383 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  28.28 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  26.14 
 
 		 386 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  26.67 
 
 		 400 aa  98.2  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  27.27 
 
 		 377 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  26.29 
 
 		 372 aa  97.8  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  26.55 
 
 		 378 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  27.27 
 
 		 377 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  25.9 
 
 		 524 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  26.38 
 
 		 406 aa  97.4  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  26.45 
 
 		 485 aa  97.1  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  28.89 
 
 		 395 aa  97.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  26.33 
 
 		 525 aa  97.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  25.9 
 
 		 524 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  25.75 
 
 		 517 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  27.22 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  27.55 
 
 		 515 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  28.12 
 
 		 382 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  28.42 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  27.01 
 
 		 387 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  26.07 
 
 		 505 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 520 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 520 aa  95.5  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 520 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  26.74 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  26.05 
 
 		 377 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  27.61 
 
 		 516 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  23.83 
 
 		 517 aa  94.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0969  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  27.15 
 
 		 536 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  26.32 
 
 		 460 aa  94.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4480  pyruvate carboxyltransferase  27.19 
 
 		 429 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  26.33 
 
 		 524 aa  94  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  26.97 
 
 		 520 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  25.92 
 
 		 503 aa  93.6  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  29.15 
 
 		 384 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  25.5 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1913  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  24.45 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.836484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  25.36 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  27.62 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>