294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1009 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  65.1 
 
 		 609 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  56.76 
 
 		 620 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  56.57 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  58.33 
 
 		 611 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  56.42 
 
 		 609 aa  361  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  54.73 
 
 		 608 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  51.68 
 
 		 459 aa  341  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  50.67 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  53.16 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 470 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  40.36 
 
 		 419 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  39.18 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  36.67 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  34.83 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  41.27 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  27.8 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  28.97 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.42 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  25.93 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  25.09 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  24.63 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  27.27 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  27.54 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  27.82 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  28.68 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  34.83 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  26.91 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  25.91 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  25.4 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  25.79 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  34.81 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  24.71 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  25.61 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  28.62 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  25.75 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  24.54 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  26.02 
 
 		 492 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  27.91 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  26.05 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  27.95 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  26.14 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  27.08 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  25.19 
 
 		 492 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  24.6 
 
 		 505 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  30.56 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  27.31 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  26.38 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  27.17 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  32.22 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  26.3 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  25.38 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  25.38 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  28.02 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  29.1 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  29.08 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  26.71 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  26.36 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  25.1 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  33.7 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  24.36 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  32.72 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  29.08 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  25.2 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  25.41 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  27.48 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  24.18 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  24.54 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  29.02 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0529  homocitrate synthase  29.02 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  24.41 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  28.57 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  28.24 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0409  pyruvate carboxyltransferase  29.64 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000285195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  26.38 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  28.02 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  29.12 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  27.67 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  24.18 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  23.44 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  23.9 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  25.2 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  24.24 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  30.77 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  28.89 
 
 		 448 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  26.94 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  27.56 
 
 		 504 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  28.63 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  27.56 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0507  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.19 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  25.9 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  28.14 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  25.71 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  26.64 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  27.94 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  22.39 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  28.4 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  25.1 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  25.97 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>