More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3301 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  55.22 
 
 		 604 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  55.65 
 
 		 611 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  56.19 
 
 		 620 aa  698    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  55.8 
 
 		 609 aa  709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 609 aa  1259    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  54.68 
 
 		 608 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  55.02 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  55.22 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  53.99 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  51.74 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  51.54 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  65.1 
 
 		 311 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  39.27 
 
 		 436 aa  289  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  38.67 
 
 		 419 aa  279  9e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  32.69 
 
 		 442 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  32 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  34.33 
 
 		 353 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  30.86 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  28.92 
 
 		 382 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  30.03 
 
 		 383 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  31.79 
 
 		 390 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  31.01 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  29.86 
 
 		 380 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  27.54 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  29.86 
 
 		 377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  27.67 
 
 		 492 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  30.92 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  26.96 
 
 		 514 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  27.54 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  27.99 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  29.26 
 
 		 392 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  29.36 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.69 
 
 		 386 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  25.72 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  28.33 
 
 		 504 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  27.11 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  27.19 
 
 		 377 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  27.11 
 
 		 492 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  31.37 
 
 		 382 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  28.44 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.82 
 
 		 504 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  29.39 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  29.52 
 
 		 382 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  30.35 
 
 		 383 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  28.41 
 
 		 384 aa  107  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  28.41 
 
 		 385 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  28.17 
 
 		 377 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  28.49 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  28.03 
 
 		 383 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  28.14 
 
 		 402 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  27.03 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  28.57 
 
 		 400 aa  105  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  26.59 
 
 		 415 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  28 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  27.82 
 
 		 413 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  26.09 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  28.53 
 
 		 378 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  28.05 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  29.63 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  27.33 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  27.25 
 
 		 438 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  28.82 
 
 		 384 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  29.48 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  27.56 
 
 		 377 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  26.23 
 
 		 377 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  26.23 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  28.41 
 
 		 379 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  28.45 
 
 		 378 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  29.01 
 
 		 394 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  28.12 
 
 		 380 aa  99.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  26.77 
 
 		 378 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.99 
 
 		 496 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  26 
 
 		 492 aa  98.2  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  27.4 
 
 		 555 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  28.41 
 
 		 378 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  26.33 
 
 		 387 aa  97.4  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  26.69 
 
 		 389 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  27.75 
 
 		 384 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  25.5 
 
 		 387 aa  95.9  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  27.43 
 
 		 389 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  25.38 
 
 		 398 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  26.65 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  28.11 
 
 		 345 aa  95.5  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.07 
 
 		 500 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  26.48 
 
 		 382 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  28.41 
 
 		 395 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  26.6 
 
 		 386 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  25.3 
 
 		 386 aa  94  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  24.3 
 
 		 502 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  26.6 
 
 		 386 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  25.14 
 
 		 393 aa  93.2  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  25.51 
 
 		 390 aa  92.8  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  24.71 
 
 		 386 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  25.15 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  24.71 
 
 		 386 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  26.96 
 
 		 377 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  26.06 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  25.31 
 
 		 393 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  28.41 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>