More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2536 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  76.04 
 
 		 604 aa  990    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  87 
 
 		 609 aa  1114    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  54.55 
 
 		 609 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  67.82 
 
 		 611 aa  900    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 608 aa  1269    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  66 
 
 		 620 aa  853    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  52.1 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  52.58 
 
 		 459 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  52.8 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  51.87 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  52.45 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1009  pyruvate carboxyltransferase  54.73 
 
 		 311 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  39.49 
 
 		 419 aa  294  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  38.39 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  32.43 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  32.6 
 
 		 425 aa  197  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  31.53 
 
 		 353 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  30.46 
 
 		 381 aa  134  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  28.44 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  27.52 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  28.53 
 
 		 382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  30.23 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  27.52 
 
 		 492 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.3 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  27.46 
 
 		 503 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  28.29 
 
 		 381 aa  121  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  29.33 
 
 		 397 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  29.07 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  28.57 
 
 		 377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  29.34 
 
 		 387 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  29.08 
 
 		 389 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  29.89 
 
 		 394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.85 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  26.88 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  29.41 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  27.87 
 
 		 383 aa  114  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  30.52 
 
 		 390 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  27.4 
 
 		 400 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  30.1 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  27.58 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  30.1 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  25.5 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  28.76 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  28.43 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  29.09 
 
 		 378 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  27.67 
 
 		 386 aa  109  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  28.26 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  29.29 
 
 		 372 aa  108  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  28.12 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  28.61 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  28.18 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  30.4 
 
 		 384 aa  107  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  28.17 
 
 		 386 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4715  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.3 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  27.5 
 
 		 383 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  28.06 
 
 		 384 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  25.38 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  26.5 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1105  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.24 
 
 		 561 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  27.02 
 
 		 413 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  28.84 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  25.51 
 
 		 386 aa  104  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  26.78 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0718  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  28.25 
 
 		 538 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  27.45 
 
 		 407 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  27.78 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  24.86 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  25 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  28.7 
 
 		 519 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  26.57 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  27.78 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  26.01 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  28.33 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  25.48 
 
 		 514 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  26.67 
 
 		 382 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  25.21 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  26.16 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 524 aa  101  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  25.21 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  27.5 
 
 		 524 aa  101  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  27.5 
 
 		 372 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  27.15 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  25.98 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  27.17 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  25.56 
 
 		 514 aa  100  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0833  pyruvate carboxyltransferase  25.31 
 
 		 373 aa  100  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  27.04 
 
 		 386 aa  100  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0969  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  28.34 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  26.1 
 
 		 382 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  27.58 
 
 		 377 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1179  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.79 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  26.63 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  29.17 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  27.6 
 
 		 448 aa  98.6  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0137  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  24.94 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  27.51 
 
 		 382 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  26.63 
 
 		 520 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1913  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.94 
 
 		 536 aa  97.8  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.836484 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  26.91 
 
 		 516 aa  97.4  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  27.07 
 
 		 504 aa  97.4  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>