More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0624 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0624  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 442 aa  902    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1075  pyruvate carboxyltransferase  68.25 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00051273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0336  pyruvate carboxyltransferase  65.98 
 
 		 353 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3097  pyruvate carboxyltransferase  33.88 
 
 		 470 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000195078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2177  pyruvate carboxyltransferase  35.28 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.282539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2226  pyruvate carboxyltransferase  34.73 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0518  pyruvate carboxyltransferase  32.53 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0305589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3157  pyruvate carboxyltransferase  32.46 
 
 		 459 aa  216  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000266472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  32.69 
 
 		 609 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  32.06 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  31.92 
 
 		 611 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  36.71 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  34.38 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  32.43 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  32.43 
 
 		 608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  36.18 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  34.97 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  30.55 
 
 		 604 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  35.08 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  35.57 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  34.71 
 
 		 386 aa  196  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  35.06 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  34.81 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.63 
 
 		 505 aa  193  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1917  pyruvate carboxyltransferase  31.06 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  35.1 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  33.76 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  34.78 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  34.81 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  33.5 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  34.17 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  34.29 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  33.89 
 
 		 386 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  32.5 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  33.05 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  34.22 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  34.9 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  33.63 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  33.82 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  34.09 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  31.93 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  33.81 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  34.97 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  31.41 
 
 		 389 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  33.81 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  33.43 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  32.67 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  34.94 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  35.28 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  32.81 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.95 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  32.04 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  35.14 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  34.82 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  32.82 
 
 		 378 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  33.72 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  33.15 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  34.43 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  34.43 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  32.99 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  31.55 
 
 		 485 aa  173  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  32.93 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  35.06 
 
 		 509 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  31.97 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.52 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  32.63 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  33.04 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  32.15 
 
 		 514 aa  171  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.64 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  32.63 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  33.53 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.19 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  31.91 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.08 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  32.94 
 
 		 377 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  32.84 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  32.18 
 
 		 503 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  31.75 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  31.65 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  33.05 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  33.81 
 
 		 515 aa  163  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  34.08 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  32.74 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  34.08 
 
 		 515 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  34.01 
 
 		 556 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  31.2 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  32.86 
 
 		 524 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  32.62 
 
 		 515 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  32.29 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2246  pyruvate carboxyltransferase  31.51 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  31.4 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  33.72 
 
 		 556 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  32.69 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  32.14 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  31.56 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  31.75 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>