147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1664 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  36.05 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 367 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  36.89 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  41.98 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  32.8 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  34.76 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  25.78 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 349 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  25.21 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2192  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 234 aa  44.7  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  36.84 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>