225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0135 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  29.56 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  32 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  39.47 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 304 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 272 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  31 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.95 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  26.22 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>