More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5353 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  54.34 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  47.6 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  32.54 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.39 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  26.17 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.75 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  40.59 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  35.11 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  24.15 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  32.08 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  40.79 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  40.62 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 272 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>