More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0147 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  905    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  51.35 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  47.36 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  36.98 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  38.16 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 499 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  32.47 
 
 		 485 aa  249  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 554 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 486 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  34.85 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 525 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  30.48 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 518 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  31.62 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  32.61 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 498 aa  216  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.38 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.94 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.94 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.94 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.94 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  27.94 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.49 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 448 aa  176  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.28 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 461 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.49 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 458 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 471 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 478 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 486 aa  156  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  29 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.67 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 456 aa  150  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 447 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  23.99 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 466 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  28.44 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.32 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 439 aa  137  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>