More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1568 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  52.87 
 
 		 1040 aa  1018    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  61.52 
 
 		 1053 aa  1202    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  52.09 
 
 		 1054 aa  1079    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  68.53 
 
 		 1064 aa  1348    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  54.9 
 
 		 1074 aa  1093    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1043 aa  2070    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  55.36 
 
 		 1050 aa  1089    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.49 
 
 		 1052 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1121 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.84 
 
 		 1041 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1063 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1048 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  36.53 
 
 		 1131 aa  538  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1067 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1067 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1063 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1063 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1063 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1063 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1067 aa  532  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.05 
 
 		 1067 aa  522  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  30.97 
 
 		 1044 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1055 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1033 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.21 
 
 		 1067 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1049 aa  515  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1137 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1053 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1041 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1032 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  32.63 
 
 		 1039 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  34.97 
 
 		 1135 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1050 aa  499  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1030 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1034 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1033 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1035 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1038 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  32 
 
 		 1042 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.67 
 
 		 1034 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1035 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1069 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1051 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1041 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1041 aa  469  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1062 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  30.01 
 
 		 1050 aa  458  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1068 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1036 aa  459  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1060 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1073 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.77 
 
 		 1075 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1052 aa  452  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.4 
 
 		 1056 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1066 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1063 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1057 aa  446  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1054 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1060 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.08 
 
 		 1074 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1053 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1033 aa  432  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1053 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.49 
 
 		 1048 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.19 
 
 		 1054 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.42 
 
 		 1093 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1061 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1060 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1048 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  28.84 
 
 		 1071 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.24 
 
 		 1060 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1072 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27.06 
 
 		 1053 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1011 aa  340  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1025 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1035 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1044 aa  337  5e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1050 aa  337  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1043 aa  334  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1092 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1025 aa  331  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1098 aa  330  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.1 
 
 		 1005 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1043 aa  320  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.07 
 
 		 1044 aa  320  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.23 
 
 		 1056 aa  317  9e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1041 aa  314  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1030 aa  311  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1040 aa  310  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1034 aa  309  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1034 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.79 
 
 		 1036 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1030 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  23.92 
 
 		 1134 aa  304  7.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 		 1034 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1046 aa  302  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1038 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1048 aa  300  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1022 aa  299  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1028 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>