210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2969 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  67.84 
 
 		 520 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 538 aa  1061    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  65.32 
 
 		 537 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  47.28 
 
 		 609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  45.47 
 
 		 585 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.13 
 
 		 601 aa  316  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  36.57 
 
 		 618 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  35 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  42.34 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 558 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.32 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  23.06 
 
 		 562 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  57.94 
 
 		 170 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.75 
 
 		 525 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.2 
 
 		 525 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.37 
 
 		 407 aa  97.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.91 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.26 
 
 		 619 aa  90.1  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  28.16 
 
 		 616 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  26.54 
 
 		 547 aa  87.4  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  23.93 
 
 		 408 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  35.46 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  25.25 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.59 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  31.53 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  29.23 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.11 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.61 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  26.35 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  25.42 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  26.14 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.29 
 
 		 740 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  22.76 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  23.02 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.25 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  30.62 
 
 		 566 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  28.47 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  31.39 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  21.45 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  34.45 
 
 		 364 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  33.56 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  28.4 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  31.51 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  28.75 
 
 		 530 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  24.91 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  23.28 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  31.94 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  30.33 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  25.52 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  26.35 
 
 		 518 aa  67.4  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  30.58 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  26.86 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.88 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  23.68 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.34 
 
 		 519 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  30.87 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.87 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.87 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  25.46 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 741 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.84 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  29.66 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  32.73 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  21.26 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.08 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  31.43 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  28.24 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  23.73 
 
 		 627 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  26.89 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  27.64 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  25.88 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  26.72 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>