More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3260 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  43.89 
 
 		 193 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  43.92 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  41.26 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  38.14 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.22 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  30.88 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  29.47 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  31.22 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.42 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  38.3 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  34.69 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  41.05 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  31.89 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  38.93 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  29.5 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.08 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  34.03 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>