More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11588 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 383 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30.34 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  29.52 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  30.32 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  30.05 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.45 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.1 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  35.2 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>