More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1299 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  56.59 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  55.04 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  53.6 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  53.6 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  52.71 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  58.46 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  48.48 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  56.92 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2715  methylation  55.04 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0720544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  56.45 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  49.21 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  40.71 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.12 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  38.28 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  40.15 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  34.4 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  38.52 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.62 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  36.36 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  41.04 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.72 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.61 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  35.34 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.81 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  33.58 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  35.25 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  35.25 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  33.33 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  33.33 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  37.76 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  30.19 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  48.39 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  29.77 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  34.85 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  43.66 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  35.19 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  31.5 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.5 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  50 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.78 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  56.6 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11830  type IV PilE-like pilus assembly protein  38.46 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  37.59 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  37.59 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.59 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  34.13 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  52.38 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.07 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  33.59 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  32.86 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  30.14 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  31.11 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.14 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  34.75 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  31.03 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  30.71 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.73 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  44.07 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  28.19 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.06 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  32.24 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.43 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  31.54 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  34.93 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  35.23 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  29.5 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  34 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  38.67 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  38.57 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  34.88 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  35.63 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.28 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  34.78 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.43 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.43 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  28.78 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.28 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  48 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  38.57 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  34.34 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>