113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2025 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  30.41 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  24.81 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 168 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  27.71 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  19.8 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  23.38 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  27.42 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  31.03 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 194 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  29.55 
 
 		 219 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 184 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  27.71 
 
 		 201 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 194 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>