193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2875 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  100 
 
 		 843 aa  1734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  44.98 
 
 		 839 aa  781    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  36.69 
 
 		 853 aa  612  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  38.55 
 
 		 857 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  29.83 
 
 		 848 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  30.9 
 
 		 856 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  27.64 
 
 		 855 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  29.61 
 
 		 853 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  26.86 
 
 		 828 aa  293  7e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  26.72 
 
 		 841 aa  290  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  25.18 
 
 		 877 aa  239  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  24.02 
 
 		 838 aa  207  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  22.97 
 
 		 831 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  23.79 
 
 		 849 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  23.51 
 
 		 816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  21.93 
 
 		 828 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  22.12 
 
 		 829 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  20.75 
 
 		 811 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  22.32 
 
 		 814 aa  95.5  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  24.87 
 
 		 930 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  25.4 
 
 		 905 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  39.6 
 
 		 1081 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  35.96 
 
 		 977 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1101 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1062 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  34.31 
 
 		 925 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  28.23 
 
 		 854 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 992 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  38.54 
 
 		 1005 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 933 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1173 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1050 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1047 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1081 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.9 
 
 		 957 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  32.46 
 
 		 979 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1104 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1062 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1041 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 1076 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1040 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1117 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 986 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  38.64 
 
 		 381 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_002950  PG1020  hypothetical protein  33.7 
 
 		 936 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00854238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1050 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1051 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 1097 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  39.64 
 
 		 971 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1085 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1064 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 1045 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  32.14 
 
 		 848 aa  51.6  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 971 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 946 aa  51.6  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.2 
 
 		 1071 aa  51.6  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 854 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1085 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1083 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 1043 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  37.11 
 
 		 1028 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1063 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1095 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1093 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1087 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 976 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 787 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 1137 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1107 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 1004 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1095 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 984 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 757 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 791 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1079 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1082 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1060 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 		 613 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1027 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1096 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 922 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1161 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 952 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.61 
 
 		 1019 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 1029 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1037 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1013 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1040 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 1008 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1006 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>