More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0616 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  46.97 
 
 		 1059 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  40.64 
 
 		 1028 aa  705    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1063 aa  2141    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  51.18 
 
 		 1129 aa  1001    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  40.21 
 
 		 1031 aa  673    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  37.8 
 
 		 1010 aa  605  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 		 1127 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 1098 aa  595  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  35.76 
 
 		 1153 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  36.23 
 
 		 1058 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 1041 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 1105 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1065 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 		 1059 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 1093 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1038 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1074 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1063 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1142 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1051 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1059 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1147 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1033 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1135 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1138 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1153 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  32.74 
 
 		 1071 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1073 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 1166 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1040 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.18 
 
 		 1065 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1043 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1022 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1038 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1081 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1043 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1064 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1033 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1068 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1081 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1165 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1036 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1087 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1047 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1078 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1067 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1071 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1008 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 1051 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 1234 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1101 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1189 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1163 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1169 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  30.75 
 
 		 1032 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1073 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1081 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  33.44 
 
 		 1137 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1050 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1115 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 1039 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1071 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1011 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1072 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1102 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1186 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1044 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1088 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1098 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1099 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1088 aa  364  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.88 
 
 		 1083 aa  363  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1138 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1107 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1027 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1116 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1057 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.17 
 
 		 1025 aa  338  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1084 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 962 aa  310  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1176 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1027 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 1037 aa  264  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1040 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1066 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1161 aa  258  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1010 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1116 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1046 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1023 aa  248  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1124 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1085 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1008 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1079 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1050 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1028 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1076 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1017 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1076 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1038 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>