204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 444 aa  889    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  31.22 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.1 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 452 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 453 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.07 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.64 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.85 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 421 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.32 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.15 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  24.09 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.05 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  23.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  23.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 		 961 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  26.97 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  23.93 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.8 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0255  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  22.44 
 
 		 438 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.37 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>