232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0255 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  80.56 
 
 
440 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0255  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
438 aa  890    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  36.49 
 
 
450 aa  286  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5097  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 
444 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  34.2 
 
 
438 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
423 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.78 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.38 
 
 
438 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  21.46 
 
 
459 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  20.65 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.82 
 
 
366 aa  63.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.34 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  32.81 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 
459 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 
410 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 
412 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 
468 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
424 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.93 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  19.73 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.48 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.35 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
421 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
443 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
456 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.64 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.95 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.93 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.31 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
411 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 
414 aa  53.5  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
444 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.44 
 
 
434 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 
445 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.89 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.93 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
522 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
434 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
498 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 
439 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
424 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
434 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4092  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
445 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518601  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.18 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 
444 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
443 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
442 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0089  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
951 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
429 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 
446 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>