77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0242 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  100 
 
 		 681 aa  1391    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4192  hypothetical protein  30.38 
 
 		 544 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  26.3 
 
 		 582 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  26.39 
 
 		 564 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.85 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  24.59 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1024 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  36.3 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  34.93 
 
 		 845 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 		 1799 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.64 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.56 
 
 		 870 aa  71.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.34 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.62 
 
 		 719 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 1380 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.56 
 
 		 1356 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  28.38 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 1262 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  31.03 
 
 		 1234 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.93 
 
 		 1707 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.06 
 
 		 1004 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  32.88 
 
 		 840 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  30 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 2554 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.65 
 
 		 1732 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1167 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.78 
 
 		 855 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.24 
 
 		 863 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.97 
 
 		 3295 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 1391 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.93 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.71 
 
 		 1091 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  29.75 
 
 		 972 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.46 
 
 		 1295 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.87 
 
 		 948 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  30.34 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  31.78 
 
 		 869 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  30.1 
 
 		 982 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  30.91 
 
 		 673 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  29.79 
 
 		 610 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  24.12 
 
 		 954 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  25.88 
 
 		 630 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  33.04 
 
 		 918 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  27.46 
 
 		 1035 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  29.45 
 
 		 630 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  24.17 
 
 		 611 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  30.87 
 
 		 798 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  28.07 
 
 		 726 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  29.49 
 
 		 930 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.52 
 
 		 627 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.61 
 
 		 1321 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  38.82 
 
 		 1418 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  25 
 
 		 1115 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  26.14 
 
 		 919 aa  49.3  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  30.36 
 
 		 389 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  25.87 
 
 		 638 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  30.36 
 
 		 536 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  28.4 
 
 		 801 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  30.89 
 
 		 691 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.27 
 
 		 1338 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  29.71 
 
 		 966 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  31.25 
 
 		 884 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  23.08 
 
 		 1132 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  28.87 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  26.06 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  23.38 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.46 
 
 		 957 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  30.97 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  23.95 
 
 		 627 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0454  hypothetical protein  30.43 
 
 		 408 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  21.55 
 
 		 526 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.53 
 
 		 933 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 541 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>