More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1389 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1373  diguanylate cyclase  97.67 
 
 		 557 aa  1083    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.949847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1570  GGDEF domain-containing protein  79.17 
 
 		 555 aa  912    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1412  diguanylate cyclase  97.85 
 
 		 557 aa  1086    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1389  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  100 
 
 		 557 aa  1141    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3445  diguanylate cyclase  58.96 
 
 		 556 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.358514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2700  diguanylate cyclase  76.99 
 
 		 555 aa  857    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418522  hitchhiker  0.000139033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2768  diguanylate cyclase  78.08 
 
 		 555 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.137361  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2970  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  99.28 
 
 		 557 aa  1133    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2870  diguanylate cyclase  80.62 
 
 		 555 aa  903    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1084  GGDEF domain-containing protein  60.5 
 
 		 562 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.287669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3296  diguanylate cyclase  60.32 
 
 		 507 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000430363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2961  diguanylate cyclase  51.22 
 
 		 565 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 603 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  27.54 
 
 		 612 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  26.46 
 
 		 564 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.05 
 
 		 867 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 1011 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  27.23 
 
 		 569 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  28.39 
 
 		 561 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  22.29 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  25.52 
 
 		 611 aa  99.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  25.81 
 
 		 636 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2484  GGDEF domain-containing protein  25.48 
 
 		 571 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  24.42 
 
 		 638 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  24.94 
 
 		 631 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 566 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  25.24 
 
 		 565 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  23.83 
 
 		 614 aa  91.3  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0313  diguanylate cyclase  26.36 
 
 		 577 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0308  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  23.5 
 
 		 571 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3711  diguanylate cyclase  26.36 
 
 		 571 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  29.44 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  25.63 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  23.9 
 
 		 578 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  25 
 
 		 628 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  22.76 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  23.93 
 
 		 628 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  24.73 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  25 
 
 		 621 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.25 
 
 		 868 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  33.14 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  22.44 
 
 		 625 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  22.47 
 
 		 624 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.51 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3407  translation initiation factor IF-2  38 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60542  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  31.93 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  31.93 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  23.98 
 
 		 625 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  22.77 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  25.33 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.56 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.58 
 
 		 1264 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0259  diguanylate cyclase  34.36 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  23.59 
 
 		 629 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3603  GGDEF domain-containing protein  30.14 
 
 		 570 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  28 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3341  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.15 
 
 		 655 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1815  diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.404044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.59 
 
 		 1078 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.38 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2370  diguanylate cyclase  31.21 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2650  diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 627 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  27.01 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1739  GGDEF domain protein  32.32 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1721  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  25.67 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2063  diguanylate cyclase  28.89 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25.44 
 
 		 716 aa  77  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  32.72 
 
 		 479 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  29.11 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 320 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.53 
 
 		 1050 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0028  diguanylate cyclase  28.98 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  24.21 
 
 		 641 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.84 
 
 		 853 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.14 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0485  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.15 
 
 		 1011 aa  75.5  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.89 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0930  diguanylate cyclase  29.63 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  26.37 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1688  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.9 
 
 		 901 aa  75.1  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  23.09 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.48 
 
 		 1251 aa  74.7  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  31.35 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.75 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44470  transmembrane sensor cyclic di-GMP signal transduction protein  34 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  25.05 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0413  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>