More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3454 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1034 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  42.41 
 
 		 1050 aa  838    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  82.73 
 
 		 1049 aa  1788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.02 
 
 		 1074 aa  1004    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.27 
 
 		 1041 aa  834    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  85.66 
 
 		 1067 aa  1906    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  47.8 
 
 		 1073 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  40.11 
 
 		 1121 aa  793    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1063 aa  2182    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  40.65 
 
 		 1052 aa  797    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  79.85 
 
 		 1055 aa  1758    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  47.37 
 
 		 1060 aa  994    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  99.91 
 
 		 1063 aa  2181    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  92.17 
 
 		 1063 aa  2010    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  43.83 
 
 		 1052 aa  850    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  78.43 
 
 		 1067 aa  1697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  40.04 
 
 		 1039 aa  792    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.58 
 
 		 1093 aa  929    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  36.35 
 
 		 1042 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  99.62 
 
 		 1063 aa  2172    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  46.88 
 
 		 1060 aa  998    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1032 aa  733    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 		 1062 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  44.92 
 
 		 1069 aa  878    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  48.23 
 
 		 1060 aa  977    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1068 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  56.28 
 
 		 1044 aa  1191    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1038 aa  705    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  76.4 
 
 		 1053 aa  1678    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  90.73 
 
 		 1067 aa  1981    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  91.49 
 
 		 1067 aa  1988    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  83.7 
 
 		 1050 aa  1815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  99.72 
 
 		 1063 aa  2177    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  46.95 
 
 		 1061 aa  972    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1053 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1072 aa  653    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  47.54 
 
 		 1057 aa  1005    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  36.89 
 
 		 1051 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  44.14 
 
 		 1056 aa  873    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  90.82 
 
 		 1067 aa  1991    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  83.03 
 
 		 1048 aa  1811    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  35.88 
 
 		 1075 aa  628  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1066 aa  628  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1098 aa  618  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1041 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 		 1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.73 
 
 		 1054 aa  569  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1041 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1033 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  33.03 
 
 		 1036 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1041 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.6 
 
 		 1060 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1033 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.83 
 
 		 1053 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  32.85 
 
 		 1048 aa  548  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1050 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  32.93 
 
 		 1035 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1074 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  33.83 
 
 		 1071 aa  543  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1054 aa  544  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1033 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.75 
 
 		 1034 aa  539  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1040 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1030 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1048 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1063 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1043 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1053 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1054 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1035 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1064 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.05 
 
 		 1035 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1030 aa  389  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1131 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.18 
 
 		 1135 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1034 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1092 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1056 aa  355  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1038 aa  351  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1064 aa  348  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1137 aa  343  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1044 aa  343  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1050 aa  342  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1055 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1044 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1143 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1057 aa  337  7e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.61 
 
 		 1058 aa  334  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1191 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1011 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1069 aa  328  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1063 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.27 
 
 		 1036 aa  324  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1044 aa  323  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1006 aa  322  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1043 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1034 aa  321  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  24.45 
 
 		 1134 aa  320  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1146 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1059 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>