More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0104 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  44.22 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.22 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  32.61 
 
 		 256 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  27.88 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  31.87 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  28.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  43.66 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 283 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  26.94 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  30.08 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>