101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2444 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  45.53 
 
 		 370 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  45.21 
 
 		 369 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  44.41 
 
 		 370 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  44.73 
 
 		 362 aa  315  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  44.72 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  43.6 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  43.6 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  43.87 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  45.14 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  44.82 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  43.72 
 
 		 369 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  42.16 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  42.61 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  43.94 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.77 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  40.45 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  39.74 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  38.2 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  38.2 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  37.65 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.2 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  39.33 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  38.2 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  39.33 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  40.45 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  35.92 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  38.2 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  38.2 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  41.57 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  38.2 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  38.64 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  36.45 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  33.33 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  38.46 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  38.2 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.96 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  37.08 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  38.82 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  36.05 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  37.93 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  28.35 
 
 		 203 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  28.35 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  27.56 
 
 		 203 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  34.12 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  33.71 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.58 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  33.71 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  32.22 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.58 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.99 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.98 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.34 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.26 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  31.11 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.33 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.43 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  27.56 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  30.12 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  29.49 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  28.41 
 
 		 202 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  35.94 
 
 		 462 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  32.88 
 
 		 206 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  32.22 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.06 
 
 		 405 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  31.25 
 
 		 147 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.41 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  27.78 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  32.99 
 
 		 466 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  34.52 
 
 		 205 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.52 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0434  TonB-like protein  36.76 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  32.05 
 
 		 859 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  33.33 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  32.14 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  30.38 
 
 		 209 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  28.57 
 
 		 121 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.27 
 
 		 404 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  33.33 
 
 		 565 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  36.36 
 
 		 285 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  30.77 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30 
 
 		 582 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  27.06 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  30 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  28.24 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35.09 
 
 		 115 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.53 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  25.58 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  32.14 
 
 		 209 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  26.88 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.49 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  36.14 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  30.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  28 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  23.08 
 
 		 212 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  22.62 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  31.71 
 
 		 604 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  31.08 
 
 		 221 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  29.63 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>