42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0434 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0434  TonB-like protein  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  42.86 
 
 		 207 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  42.86 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  37.04 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  42.86 
 
 		 203 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  42.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  39.68 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  42.86 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  41.27 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  41.27 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  38.57 
 
 		 93 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  41.27 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  41.27 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  42.59 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  39.68 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  36.76 
 
 		 361 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  38.1 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  36.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  40.48 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  36.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  38.1 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  38.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.92 
 
 		 206 aa  45.8  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  33.33 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  35.71 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  34.52 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  35.71 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  35.71 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40.74 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  30.61 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  29.85 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  33.33 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.57 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  28.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  28.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>