More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4017 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  53.54 
 
 		 653 aa  643    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  52.62 
 
 		 675 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  61.25 
 
 		 738 aa  802    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  58.41 
 
 		 661 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  58.33 
 
 		 666 aa  795    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  51.66 
 
 		 663 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  58.56 
 
 		 661 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  51.66 
 
 		 663 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  52.26 
 
 		 664 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  49.77 
 
 		 662 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  61.22 
 
 		 658 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  61.53 
 
 		 663 aa  805    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  51.66 
 
 		 663 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  91.32 
 
 		 657 aa  1132    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  59.45 
 
 		 657 aa  750    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  58.47 
 
 		 672 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  53.34 
 
 		 665 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  60.31 
 
 		 651 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.53 
 
 		 663 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  51.76 
 
 		 665 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  59.81 
 
 		 677 aa  747    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  63.55 
 
 		 667 aa  806    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  100 
 
 		 657 aa  1324    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  63.54 
 
 		 670 aa  799    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  52.89 
 
 		 663 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  50.62 
 
 		 661 aa  672    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  52.58 
 
 		 661 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  57.8 
 
 		 661 aa  739    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  71.36 
 
 		 671 aa  930    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  65.54 
 
 		 671 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  51.15 
 
 		 681 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  58.78 
 
 		 672 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  91.48 
 
 		 657 aa  1133    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  51.66 
 
 		 663 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  74.54 
 
 		 668 aa  934    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  60.89 
 
 		 663 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  51.22 
 
 		 663 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  57.74 
 
 		 681 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  52.35 
 
 		 666 aa  646    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  60.62 
 
 		 657 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  52.98 
 
 		 660 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  53.34 
 
 		 663 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  57.6 
 
 		 666 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  64.06 
 
 		 660 aa  784    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.55 
 
 		 694 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  64.21 
 
 		 684 aa  833    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  65.54 
 
 		 671 aa  843    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  57.95 
 
 		 662 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  60.71 
 
 		 655 aa  767    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  48.56 
 
 		 663 aa  660    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  58.69 
 
 		 671 aa  764    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  61.28 
 
 		 655 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  64.92 
 
 		 673 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  57.65 
 
 		 686 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  60.31 
 
 		 657 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  63.87 
 
 		 695 aa  846    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  51.66 
 
 		 663 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  64.2 
 
 		 671 aa  840    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  58.41 
 
 		 662 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  52.17 
 
 		 671 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  53.12 
 
 		 663 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  56.26 
 
 		 678 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.47 
 
 		 680 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  52.91 
 
 		 665 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  52.17 
 
 		 664 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  51.65 
 
 		 723 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  57.19 
 
 		 673 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  60.09 
 
 		 660 aa  745    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.09 
 
 		 653 aa  692    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  57.76 
 
 		 681 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  60.28 
 
 		 686 aa  773    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  52.17 
 
 		 671 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  51.72 
 
 		 664 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  53 
 
 		 666 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  53.41 
 
 		 665 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  58.46 
 
 		 660 aa  731    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  52.37 
 
 		 665 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  58.17 
 
 		 672 aa  727    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  58.7 
 
 		 665 aa  753    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  57.76 
 
 		 681 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.74 
 
 		 663 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  61.82 
 
 		 672 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  47.86 
 
 		 690 aa  634  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.53 
 
 		 665 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.17 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.72 
 
 		 664 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50.9 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  50.83 
 
 		 665 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  52.1 
 
 		 664 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.05 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.6 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  50.9 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  52.58 
 
 		 668 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  51.05 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  53.02 
 
 		 680 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  52.52 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>