237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0407 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 492 aa  1006    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  56.67 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  56.07 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  44.9 
 
 		 493 aa  412  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  42.33 
 
 		 513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  41.1 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  41.1 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  36.65 
 
 		 485 aa  343  5.999999999999999e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  37.53 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  39.41 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  37.34 
 
 		 493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  38.04 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  36.93 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 1177 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  26.5 
 
 		 1101 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 1214 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  24.96 
 
 		 1118 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 1118 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  25.8 
 
 		 1253 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 1229 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 1153 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 1231 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  24.16 
 
 		 1193 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 1181 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  27.49 
 
 		 1173 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 1128 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 1172 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  26.28 
 
 		 1186 aa  126  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  26.34 
 
 		 1202 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  23.28 
 
 		 1165 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  22.79 
 
 		 1167 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 1164 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  22.97 
 
 		 1144 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  21.08 
 
 		 1201 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.85 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 426 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.09 
 
 		 460 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  26.4 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.19 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  24.7 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  27.32 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  25.09 
 
 		 1048 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01070  hypothetical protein  38.38 
 
 		 109 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.29 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.06 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  28.13 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  26.39 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 758 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  23.13 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  21.75 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  24.41 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  23.59 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  23.59 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  21.94 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 1126 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1967  alpha amylase, catalytic region  25.42 
 
 		 536 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000720647  hitchhiker  0.000000000127887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 		 554 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 682 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 574 aa  54.7  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 541 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  24.45 
 
 		 653 aa  53.9  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 538 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  21.73 
 
 		 654 aa  53.5  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  48.33 
 
 		 614 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60352  alpha-glucosidase maltase  22.98 
 
 		 572 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  28.1 
 
 		 1196 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 		 581 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 716 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0222  alpha amylase, catalytic region  24.28 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0439399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 535 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  28.1 
 
 		 1196 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  25.67 
 
 		 539 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 545 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 524 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  28.63 
 
 		 715 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 1075 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  24.09 
 
 		 546 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  25.48 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  24.24 
 
 		 542 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 536 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  26.44 
 
 		 1122 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  26.01 
 
 		 607 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>