More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3363 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  52.57 
 
 		 1033 aa  1099    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1043 aa  2117    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 1059 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1065 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1051 aa  556  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.61 
 
 		 1058 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1074 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.95 
 
 		 1028 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 1166 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  35.67 
 
 		 1059 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 1105 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.92 
 
 		 1065 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1129 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1135 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1038 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1063 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1063 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1022 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1040 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 1093 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1153 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1031 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1059 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 		 1051 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1138 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1142 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1081 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1078 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 1032 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 1067 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1147 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1234 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1127 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1081 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1071 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1115 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1068 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1072 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1087 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1071 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1137 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  30.67 
 
 		 1071 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1073 aa  423  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1047 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1073 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  32.26 
 
 		 1083 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1101 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1038 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1102 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1165 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1064 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1081 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1189 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1041 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 1010 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1043 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1098 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  31.04 
 
 		 1025 aa  399  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1163 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1033 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1186 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1088 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1169 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1036 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1098 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1011 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1099 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1027 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1153 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.58 
 
 		 1050 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1107 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1044 aa  347  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 1039 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1008 aa  344  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1176 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1138 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1116 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1084 aa  293  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1057 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1040 aa  264  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1046 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 1029 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1109 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1102 aa  237  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 979 aa  234  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1076 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1132 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1023 aa  231  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1117 aa  230  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.42 
 
 		 925 aa  226  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1037 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1066 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 962 aa  225  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1049 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 986 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1163 aa  221  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1155 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1124 aa  218  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1077 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>