182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1050 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1157 aa  2381    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  94.24 
 
 		 1172 aa  1810    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.58 
 
 		 1753 aa  503  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  36.1 
 
 		 1743 aa  463  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  32.84 
 
 		 1461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1409 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  31.88 
 
 		 1463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  30.75 
 
 		 1480 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  31 
 
 		 1073 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1179 aa  207  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  33.19 
 
 		 503 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  25.15 
 
 		 2418 aa  171  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  33.26 
 
 		 809 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  24.22 
 
 		 1740 aa  131  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  38.85 
 
 		 913 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  24.5 
 
 		 2864 aa  99.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  27.83 
 
 		 3794 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 628 aa  87  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.42 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  76 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.25 
 
 		 482 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1517 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  23.43 
 
 		 2513 aa  75.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1600 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1352 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  26.35 
 
 		 2510 aa  73.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  28.62 
 
 		 2513 aa  72  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  31.58 
 
 		 1053 aa  72  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 2374 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.9 
 
 		 1485 aa  71.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1959 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.98 
 
 		 2145 aa  70.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  28.81 
 
 		 1976 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  38.68 
 
 		 2843 aa  68.6  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.46 
 
 		 2497 aa  68.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  37.6 
 
 		 3662 aa  68.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1834 aa  66.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1658 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  26.5 
 
 		 2413 aa  65.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  27.57 
 
 		 3456 aa  65.1  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.03 
 
 		 2225 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  29.03 
 
 		 1599 aa  65.1  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  26.58 
 
 		 2652 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 2032 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1840 aa  63.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.02 
 
 		 3273 aa  63.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1854 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.26 
 
 		 1384 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.9 
 
 		 2094 aa  63.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.07 
 
 		 2017 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1917 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.02 
 
 		 678 aa  62  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  23.97 
 
 		 2031 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.65 
 
 		 2658 aa  61.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  26.35 
 
 		 722 aa  60.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 3193 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 2437 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1081 aa  60.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 869 aa  61.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1935 aa  60.1  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.08 
 
 		 2224 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.08 
 
 		 2224 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 2401 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.92 
 
 		 2224 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.62 
 
 		 2096 aa  60.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  25.58 
 
 		 2349 aa  59.7  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.97 
 
 		 765 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  51.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1433 aa  59.3  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 2031 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.43 
 
 		 2350 aa  58.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  27.76 
 
 		 1427 aa  58.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1806 aa  58.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1825 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1825 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.57 
 
 		 788 aa  57.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.57 
 
 		 788 aa  57.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.14 
 
 		 2246 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 2486 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  28.11 
 
 		 927 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.95 
 
 		 1586 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.95 
 
 		 1595 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  36.21 
 
 		 928 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  24.07 
 
 		 2191 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  25.44 
 
 		 2443 aa  57.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 2831 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.42 
 
 		 1576 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1623 aa  55.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.77 
 
 		 2178 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.38 
 
 		 2417 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1405 aa  55.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 927 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1942 aa  55.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 3333 aa  55.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.11 
 
 		 2221 aa  55.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3884  YD repeat protein  26.64 
 
 		 1879 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.22 
 
 		 2458 aa  54.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.05 
 
 		 2762 aa  54.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 2283 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>