222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4004 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  41.11 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  31.64 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  37.89 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 332 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  36.51 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.51 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 179 aa  45.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3771  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.179625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>