More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0369 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  35.6 
 
 		 1170 aa  650    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.3 
 
 		 1148 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  35.31 
 
 		 1157 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  35.77 
 
 		 1246 aa  708    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  54.7 
 
 		 1175 aa  1268    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  35.26 
 
 		 1169 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1169 aa  722    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1176 aa  727    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  37.72 
 
 		 1177 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  33.42 
 
 		 1168 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1170 aa  742    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  52.66 
 
 		 1168 aa  1266    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.52 
 
 		 1179 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  37.24 
 
 		 1176 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1178 aa  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1176 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  54.28 
 
 		 1170 aa  1274    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 		 1165 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.8 
 
 		 1177 aa  734    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  34.14 
 
 		 1157 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1167 aa  2390    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  36.13 
 
 		 1178 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  35.76 
 
 		 1197 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  38.17 
 
 		 1176 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  51.88 
 
 		 1188 aa  1294    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  60.45 
 
 		 1193 aa  1497    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  33.82 
 
 		 1164 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  33.48 
 
 		 1174 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  59.43 
 
 		 1169 aa  1420    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1157 aa  656    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  61.18 
 
 		 1192 aa  1558    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  52.9 
 
 		 1158 aa  1257    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  60.93 
 
 		 1192 aa  1535    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  35.93 
 
 		 1158 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  34.66 
 
 		 1183 aa  707    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1176 aa  728    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  37.24 
 
 		 1176 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  54.41 
 
 		 1174 aa  1281    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  52.6 
 
 		 1153 aa  1319    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  53.15 
 
 		 1169 aa  1343    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1183 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  98.8 
 
 		 1167 aa  2362    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  34.76 
 
 		 1218 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  35.67 
 
 		 1220 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  53.55 
 
 		 1169 aa  1268    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  37.6 
 
 		 1176 aa  728    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.21 
 
 		 1179 aa  675    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  51.57 
 
 		 1166 aa  1270    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  33.73 
 
 		 1147 aa  650    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  34.98 
 
 		 1244 aa  640    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.11 
 
 		 1154 aa  667    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  38.09 
 
 		 1123 aa  710    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1176 aa  732    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1141 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  36.22 
 
 		 1196 aa  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  36.82 
 
 		 1148 aa  660    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  34.82 
 
 		 1182 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  34.98 
 
 		 1193 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  34.63 
 
 		 1265 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  35.21 
 
 		 1168 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 		 1162 aa  731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1162 aa  737    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  50.95 
 
 		 1180 aa  1227    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1174 aa  714    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1157 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  34.31 
 
 		 1176 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  52.73 
 
 		 1158 aa  1254    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1157 aa  654    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  34 
 
 		 1207 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  36.02 
 
 		 1162 aa  683    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  34.94 
 
 		 1165 aa  697    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  34.52 
 
 		 1179 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1168 aa  687    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1176 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1182 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  34.07 
 
 		 1165 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  34.48 
 
 		 1192 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  34.11 
 
 		 1177 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  35.21 
 
 		 1168 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  33.51 
 
 		 1224 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  34.75 
 
 		 1112 aa  665    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1176 aa  727    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  32.6 
 
 		 1218 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  31.88 
 
 		 1161 aa  634  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  33.9 
 
 		 1182 aa  635  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  34.02 
 
 		 1199 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1153 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  33.23 
 
 		 1112 aa  632  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  34.31 
 
 		 1202 aa  631  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  33.87 
 
 		 1212 aa  632  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  34.36 
 
 		 1155 aa  627  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1153 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  33 
 
 		 1126 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  32.91 
 
 		 1161 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8585  transcription-repair coupling factor  34.52 
 
 		 1204 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  33.94 
 
 		 1113 aa  623  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  33.27 
 
 		 1155 aa  625  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  35.45 
 
 		 1059 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  33.39 
 
 		 1212 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  46.13 
 
 		 1197 aa  621  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>