More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8585 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  37.86 
 
 		 1148 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  37.66 
 
 		 1164 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1148 aa  759    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  43.7 
 
 		 1157 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  37.86 
 
 		 1155 aa  681    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1169 aa  729    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1569  transcription-repair coupling factor  38.36 
 
 		 1184 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.878317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2550  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1161 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277957  normal  0.0823791 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1176 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  41.42 
 
 		 1207 aa  761    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1165 aa  646    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  38.24 
 
 		 1155 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1164 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.08 
 
 		 1176 aa  773    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1178 aa  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.14 
 
 		 1176 aa  772    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  36.97 
 
 		 1168 aa  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  37.17 
 
 		 1153 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  36.96 
 
 		 1153 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  54.64 
 
 		 1211 aa  1275    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1148 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  70.68 
 
 		 1210 aa  1658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  34.52 
 
 		 1167 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  40.93 
 
 		 1148 aa  758    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  37.97 
 
 		 1174 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  36.56 
 
 		 1188 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4359  transcription-repair coupling factor  37.08 
 
 		 1174 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281858  normal  0.0471962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  65.9 
 
 		 1188 aa  1446    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  36.3 
 
 		 1149 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  62.77 
 
 		 1193 aa  1443    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  39.58 
 
 		 1161 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.19 
 
 		 1176 aa  778    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  38.65 
 
 		 1160 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1192 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  36.67 
 
 		 1157 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  38.03 
 
 		 1192 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  43.48 
 
 		 1158 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1159 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.08 
 
 		 1176 aa  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  37.03 
 
 		 1157 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  39.39 
 
 		 1153 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2848  transcription-repair coupling factor  37.91 
 
 		 1164 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.420758  normal  0.818462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1162 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  39.32 
 
 		 1183 aa  754    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  36.7 
 
 		 1157 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  55.64 
 
 		 1198 aa  1246    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  64.66 
 
 		 1208 aa  1432    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2850  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1171 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  62.72 
 
 		 1216 aa  1439    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  37.17 
 
 		 1157 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1137 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  36.49 
 
 		 1153 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1179 aa  692    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  37.53 
 
 		 1134 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2717  transcription-repair coupling factor  37.28 
 
 		 1201 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  38.42 
 
 		 1160 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1179 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  37.13 
 
 		 1166 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  62.61 
 
 		 1218 aa  1427    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2053  transcription-repair coupling factor  37.96 
 
 		 1173 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0242332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 		 1174 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1182 aa  724    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  41.48 
 
 		 1265 aa  772    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1159 aa  753    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3640  transcription-repair coupling factor  37.4 
 
 		 1170 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  54.55 
 
 		 1211 aa  1272    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4262  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1168 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1160 aa  666    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  42.02 
 
 		 1246 aa  770    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  41.43 
 
 		 1169 aa  801    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  38.85 
 
 		 1162 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1162 aa  780    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  36.88 
 
 		 1143 aa  671    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4157  transcription repair coupling factor  37.41 
 
 		 1171 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1160 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1160 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3157  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1164 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1178 aa  794    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  47.02 
 
 		 1073 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  55.57 
 
 		 1234 aa  1268    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1179 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  37.84 
 
 		 1162 aa  700    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  36.97 
 
 		 1168 aa  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.62 
 
 		 1165 aa  712    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.97 
 
 		 1179 aa  637    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1168 aa  653    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  58.95 
 
 		 1222 aa  1330    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1148 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  38.59 
 
 		 1189 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  39.13 
 
 		 1198 aa  691    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1160 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  60.42 
 
 		 1192 aa  1343    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.96 
 
 		 1177 aa  737    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  38.46 
 
 		 1153 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  36.29 
 
 		 1148 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  61.54 
 
 		 1224 aa  1435    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  38.56 
 
 		 1155 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  54.55 
 
 		 1211 aa  1272    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 		 1176 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  56.1 
 
 		 1212 aa  1273    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>