More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1044 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  100 
 
 
494 aa  975    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  54.81 
 
 
524 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  54.18 
 
 
503 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  50 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  49.04 
 
 
492 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  50.9 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  47.22 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  47.75 
 
 
521 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  47.17 
 
 
503 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  49.38 
 
 
481 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  43.67 
 
 
482 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  35.03 
 
 
469 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  34.37 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  34.81 
 
 
469 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  34.67 
 
 
469 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  33.92 
 
 
469 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  33.92 
 
 
469 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  33.92 
 
 
469 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  33.92 
 
 
469 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  33.92 
 
 
469 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  35.08 
 
 
469 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  35.08 
 
 
469 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  34.85 
 
 
469 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  34.94 
 
 
469 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  35.29 
 
 
491 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  33.92 
 
 
480 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  36.71 
 
 
476 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
471 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  33.79 
 
 
455 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  35.13 
 
 
458 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  32.66 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  32.66 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  34 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  33.85 
 
 
449 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  33.87 
 
 
436 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  32.13 
 
 
472 aa  193  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
485 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
448 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
486 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
490 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.81 
 
 
481 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.53 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.02 
 
 
525 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.46 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.66 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.72 
 
 
518 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.25 
 
 
500 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.04 
 
 
463 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.27 
 
 
454 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
498 aa  136  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  34.02 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.39 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
499 aa  134  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.63 
 
 
448 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
443 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  33.8 
 
 
238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.18 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.84 
 
 
462 aa  131  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
538 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
446 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  26.78 
 
 
477 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
485 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  28.53 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
475 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
458 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
505 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
554 aa  123  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.81 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  20.71 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.06 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.47 
 
 
454 aa  120  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  28.87 
 
 
458 aa  117  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
462 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.58 
 
 
463 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.66 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.81 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
453 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  30.25 
 
 
446 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
452 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>