More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0729 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
268 aa  544  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  61.04 
 
 
271 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  62.86 
 
 
260 aa  271  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  59.53 
 
 
278 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  61.57 
 
 
278 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  59.17 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  48.95 
 
 
269 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.67 
 
 
264 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  42.74 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  47.42 
 
 
309 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  47.37 
 
 
281 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.61 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 
290 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  39.53 
 
 
279 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 
266 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  44.81 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.81 
 
 
282 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  42.86 
 
 
272 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  39.32 
 
 
267 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 
326 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.44 
 
 
266 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 
273 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
269 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.96 
 
 
795 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
522 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25.79 
 
 
955 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.94 
 
 
623 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 
632 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 
626 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
505 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  28.81 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
615 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 
542 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
3145 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
620 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
639 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  29.66 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  29.66 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
636 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.28 
 
 
810 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  30.17 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
612 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 
626 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 
626 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.67 
 
 
566 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.68 
 
 
620 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
955 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
2651 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
543 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
750 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
635 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
557 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
878 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 
610 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
1085 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
635 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
595 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
935 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
637 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
1737 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
739 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.71 
 
 
602 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 
566 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 
425 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
632 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
566 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.44 
 
 
732 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 
714 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  34.48 
 
 
467 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
611 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
465 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.31 
 
 
733 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.81 
 
 
816 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
511 aa  52.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
4079 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.71 
 
 
676 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
909 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  32.77 
 
 
395 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
610 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  27.42 
 
 
514 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
587 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
685 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  29.37 
 
 
344 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
767 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
607 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.27 
 
 
677 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
2679 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  27.27 
 
 
817 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
681 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>