More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3441 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  43.26 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  36.81 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 383 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 192 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.66 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.4 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.41 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.95 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  37.01 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.84 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  32.4 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  35.46 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  28.82 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>