231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0860 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  60.43 
 
 		 1011 aa  1179    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  46.76 
 
 		 1204 aa  859    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  45.58 
 
 		 1109 aa  797    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  100 
 
 		 1131 aa  2219    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  61.83 
 
 		 895 aa  892    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  40.73 
 
 		 862 aa  532  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  42.08 
 
 		 855 aa  527  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  41.11 
 
 		 872 aa  506  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  42.01 
 
 		 874 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  38.31 
 
 		 862 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  34.45 
 
 		 805 aa  379  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  34.77 
 
 		 842 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  29.88 
 
 		 1359 aa  313  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  35.81 
 
 		 879 aa  310  6.999999999999999e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  29.58 
 
 		 923 aa  303  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  32.82 
 
 		 832 aa  300  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  32.14 
 
 		 860 aa  295  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.09 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.46 
 
 		 748 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.04 
 
 		 812 aa  106  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  23.69 
 
 		 778 aa  99.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  30.81 
 
 		 385 aa  95.1  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.27 
 
 		 388 aa  94.7  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.41 
 
 		 752 aa  94  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  30.27 
 
 		 385 aa  93.6  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  34.09 
 
 		 380 aa  93.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.73 
 
 		 385 aa  92.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  30.37 
 
 		 905 aa  89.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  23.44 
 
 		 865 aa  89.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.43 
 
 		 767 aa  85.9  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  34.21 
 
 		 752 aa  85.5  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  29.9 
 
 		 387 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  30.14 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.89 
 
 		 869 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.4 
 
 		 747 aa  79.7  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  27.71 
 
 		 825 aa  79.7  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.79 
 
 		 869 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  33.07 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  30.16 
 
 		 864 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  30.67 
 
 		 758 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  26.11 
 
 		 808 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  30.87 
 
 		 872 aa  76.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  27.89 
 
 		 777 aa  75.1  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  27.11 
 
 		 865 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  27.49 
 
 		 835 aa  73.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  29.41 
 
 		 804 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  27.84 
 
 		 806 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.87 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  29.41 
 
 		 755 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  26.11 
 
 		 861 aa  70.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  28.07 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.43 
 
 		 800 aa  69.7  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.52 
 
 		 798 aa  69.7  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  30.14 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  33.65 
 
 		 921 aa  68.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.48 
 
 		 828 aa  68.2  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  31.39 
 
 		 845 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  32.72 
 
 		 889 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.03 
 
 		 882 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.17 
 
 		 755 aa  67.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.17 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.02 
 
 		 882 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.41 
 
 		 895 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  25.15 
 
 		 803 aa  63.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  30.29 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 		 1291 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  25.6 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  26.71 
 
 		 859 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  26.23 
 
 		 920 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  27.93 
 
 		 892 aa  62  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.73 
 
 		 1045 aa  61.6  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.42 
 
 		 898 aa  60.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.59 
 
 		 883 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  34.06 
 
 		 839 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.88 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  34.06 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  30.6 
 
 		 849 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  25.47 
 
 		 1128 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  25.53 
 
 		 899 aa  58.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  26.63 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  28.51 
 
 		 1040 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  28.78 
 
 		 1013 aa  58.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  28.51 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  26.92 
 
 		 780 aa  58.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  27.91 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  27.66 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  27.66 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  21.98 
 
 		 692 aa  57.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.01 
 
 		 883 aa  58.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  24.75 
 
 		 694 aa  57.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.12 
 
 		 881 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  32.73 
 
 		 815 aa  58.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  28.09 
 
 		 1028 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.49 
 
 		 882 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.15 
 
 		 860 aa  57  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  31.54 
 
 		 901 aa  56.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  27.09 
 
 		 821 aa  56.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  27.81 
 
 		 831 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.53 
 
 		 882 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.18 
 
 		 723 aa  55.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>